Người LGBT không bị cấm tham gia nghĩa vụ quân sự. Bộ Quốc phòng không có quy tắc nội bộ nào liên quan đến người LGBT, nhưng nó tuân theo quy định ở cấp tiểu bang, trong đó nghiêm cấm phân biệt đối xử trên cơ sở khuynh hướng tình dục. Một số báo cáo phương tiện truyền thông cho rằng hầu hết những người đồng tính nam phục vụ trong quân đội thường quyết định giữ kín xu hướng tình dục của họ, nhưng cũng có những báo cáo cho thấy Lực lượng Vũ trang Croatia rất coi trọng sự phân biệt đối xử và sẽ không tha thứ kẻ kì thịp trong số các nhân viên của nó.[12][13]

Trường hợp phân biệt đối xử

Trường hợp phân biệt đối xử duy nhất được biết đến trong Quân đội Croatia là trường hợp tuyển mộ Aldin Petrić năm 1998 từ Rijeka. Vào tháng 7 năm 1998, Petrić đã trả lời giấy triệu tập dự thảo của mình và báo cáo với doanh trại tại Pula nơi anh ta nói với sĩ quan cấp cao của mình trong một cuộc trò chuyện riêng rằng anh ta là người đồng tính tuy nhiên thông tin nhanh chóng lan truyền qua doanh trại dẫn đến việc Petrić bị đồng đội lạm dụng. binh lính và các sĩ quan khác. Petrić liên tục yêu cầu được chuyển đến một doanh trại khác nhưng yêu cầu của anh ta không được đáp ứng. Vào ngày 22 tháng 7, Petrić đã bị đuổi khỏi quân đội vì "sự xáo trộn không xác định về sở thích tình dục" (Mã F65.9 từ Phân loại Rối loạn Tâm thần và Hành vi của Tổ chức Y tế Thế giới năm 1992, tuy nhiên không đặc biệt coi đồng tính luyến ái là rối loạn tâm lý). Sau khi Petrić bị đuổi khỏi quân đội, cha mẹ anh đã phát hiện ra đồng tính luyến ái của mình và trục xuất anh ra khỏi nhà. Petrić sau đó đã kiện Bộ Quốc phòng vì những thiệt hại, với lý do "các chính sách phân biệt đối xử, sự miễn trừ chính thức đối với việc lạm dụng và chấn thương tâm lý". Vào tháng 10 năm 1998, Bộ đã triệu tập Petrić một lần nữa để anh ta hoàn thành nghĩa vụ quân sự mà anh ta từ chối vì sợ cuộc sống của mình. Sau đó Petrić đã tìm kiếm và nhận tị nạn chính trị ở Canada.[14][15]